1967-68 sezonunda 2. Lige alınan kulüp 1974-1975 yılında Türkiye 2. Ligi Beyaz Grup Şampiyonu olarak Türkiye 1.Ligi'ne yükselmiştir. 1975-1976 sezonunda ligin ilk yarısını 4. sırada bitirmesine rağmen Beşiktaş ile girdiği ligde kalma mücadelesini kaybederek,masa başı oyunlarla 2. lige düşmüştür.

1985-86 sezonu 3. Lige düşmüş, 1991-92 sezonu sonunda 3. Lig 7. Grup Şampiyonu olarak tekrar 2. Lige dönmüş, 1995-96 sezonunda Yükselme Grubu'na kalmış, Ekstra Play-Off maçlarında Kardemir Karabükspor'a 2-1 yenilmiştir.

1996-97 sezonunda yeniden 3. lige düşen kulüp. 2000-01 sezonunda Amatör'e düştü ve 5 sezon oynadıktan sonra 2005-2006 sezonunda 3. Lige döndü. 2007-2008 ve 2008-2009 Sezonlarında oynadığı Play OFF maçlarında da 2. lige çıkmayı başaramayab BALKES 2006-2007 sezonundan beri 2. lige yükselme mücadelesi vermektedir.

• 1917 Balıkesir İdmanyurdu
• 1922 İdmanbirliği
• 1925 İdmangücü
• 1941 Karesi [1961'de Karesi PD(Pamuklu Dokuma)]
• Akıncılar Gençlik
• Altıeylül
• Yıldırımspor
• Egespor
• Güvenege
• Doğan Hilâl

Balıkesirspor bu kulüplerin birleşmelerinden oluşmuştur.

1966 yılındaki kuruluş sonrası Balıkesir’in eski futbolcularından Yediveren Erdoğan (Güngören) kalem yeteneğini Karesi Futbol Takımının ambleminden esinlenerek Balıkesirspor’a uyarladı.1969-70sezonunda ise kulüp müdürü merhum Pomak Orhan (çilen) tarafından küçük bir şekil değişikliği ile kulüp amblemi bugünkü halini aldı.

Balıkesirspor amblemini B ve S harflerini niteleyen bir futbolcu figürü ile Kırmızı-Beyazlı renkler, Türkiye liglerinde de en başarılı amblemlerden biri olarak yerini alıyor.

Balıkesir futbol tarihi bir hayli eskiye dayanır ve ilk doğuşu 1920li yıllara kadar uzanır. 1929-1930 yılları arasında Bursa’dan Balıkesir Necati Bey Öğretmen okuluna gönderilen öğrenciler önderliğinde ilk futbol oynanmaya başlar.O dönemde futbolla uğraşan “Baba” Ahmet, kaleci Raşit, Ağa İbrahim, Göbek Muzaffer, Baba Hüsnü (Beşiktaşlı), Patla Ratip, Nedim Ercan, İrfan, Sarı Aziz, Bıroğan Enver ve arkadaşları Balıkesir futbolu için öncü olmuşlar ve zamanın futbol heveslisi gençlerine önayak olmuşlardır. O zamanlar gençlerin kendi imkanlarıyla kurdukları Yurt, Birlik ve güç kulupleri vardı. Bu kuluplerde oynayan yetenekli Balıkesirli gençler daha sonra İstanbul , İzmir ve Ankara kulüpleri tarafından transfer edilmişler ve o kulüplerde çok başarılı olmuşlardır.